不可以。補償辦法的適用對象是：
1.各級衛生主管機關認定應接受居家隔離、居家檢疫、集中隔離或集中檢疫者。
2.為照顧生活不能自理之受隔離或檢疫者，而請假或無法從事工作之家屬。
所以是否可以申請防疫補償，需確認是否有拿到各級衛生主管機關認定的隔離或檢疫通知書，自主管理的人不算。